Taime kloonimine või aseksuaalne paljundamine annab geneetiliselt identse koopia või lähtetaime koopiad. Taimede kloonimiseks on olemas mitmesuguseid meetodeid, nagu pistikud, lõhestamised, nihked, sibulad, võsundid, pookimine, kihistamine ja mikropaljundamine. Paljud neist sobivad nii koduaednikule kui ka kommertspõllumeestele ja aiandusalastele.
1940. aastatel laastas Panama haigus Gros Micheli kultivari abil banaaniistandusi.Geneetiline ühetaolisus
Taimede kloonimine võimaldab toota suures koguses geneetiliselt identseid taimi ühelt vanemalt. Selle geneetilise ühtluse eeliseks on see, et kõigil neil taimedel on täpselt samad geneetilised omadused, mis ei pruugi olla sugulisel paljunemisel moodustunud seemnetele üle kantud. Kuid see sõltuvus konkreetsete geneetiliste koostisega taimedest vähendab üldist geneetilist mitmekesisust. Mõnede meetmete abil on põllumajanduse geneetiline mitmekesisus langenud alates 1900. aastast 75 protsenti. See takistab Moreheadi ülikooli andmetel uute, praeguste tingimuste ja keskkonna jaoks sobivate taimesortide väljaarendamist.
Haigus vastuvõtlik
Taimede kloonimine võimaldab tootjatel kasvatada kultuursorte, mis on nende teada vastupidavad laastavatele haigustele - võimaldades seetõttu vähem herbitsiide ja pestitsiide ning vähendades majanduslikku kahju. Kui taimede põld on geneetiliselt identne, tähendab see, et kui haigus või kahjur on võimeline mõjutama ühte taime, mõjutab see tõenäoliselt kõiki neid, põhjustades laastavat majanduslikku kahju, nagu juhtus 1940. aastatel Panama haiguse ja banaanide puhul, märgib taimehaldusvõrgustik.
Haiguse levik
Taimede kloonimine on hädavajalik ainult tervetelt, haigusvabadelt vanematelt. Kui seda tehakse, saab neid paljundada koekultuurides, tagades taimede haigusvabaduse. Haigestunud taimede kloonimisel ja paljundamisel võib see põhjustada haiguse levikut kaugel selle algsest elupaigast, mõjutades senisest palju rohkem tootjaid ja tarbijaid. Kuna banaanitaimede kloonimiseks kasutatavad risoomid võivad nakatumisel tunduda Panama taudivabad, põhjustab banaanide kloonimine selle laastava haiguse levikut.
Spetsiaalsete seadmete vajadus
Spetsialiseeritud seadmed ja tarvikud, näiteks koekultuuri kasvukeskkonnad, juurdumishormoonid ja pookimiseks mõeldud pookealused võimaldavad toota palju rohkem taimi, kui see oleks võimalik ainult seemne korral. See võib olla väga kasulik, kui taimed peavad teatud vanuses ja kellaajal turul olema. Need seadmed võivad siiski olla kallid, vajavad tehnilisi teadmisi ja võivad isegi põhjustada rikkeid, põhjustades tootjale taimede, investeeringute ja aja kaotuse.
